关于2019新型冠状病毒(2019-nCoV)序列分析支持的通知

关于2019新型冠状病毒(2019-nCoV)序列分析支持的通知 (日本語) (英語)

随着2019新型冠状病毒的爆发,众多科学工作者通过一些非传统渠道(例如社交媒体,部落格,即时邮件系统)来分享他们的研究发现。近来,一位学者在推特发文表示有超过300篇新冠状病毒相关的预印本论文被刊登在bioRxiv网站,同时呼吁学界共同协助对这些预印本论文的审查工作。在众多协助请求中,我们实验室被邀请评估MAFFT序列比对软件是否被合理地使用。除了将对此作出回应,我们在此列出如下要点仅供参考。

MAFFT被广泛地运用于2019-nCoV的序列分析工作。已发表的论文如下:

为了重建这些序列比对结果,我们需要采用完全相同的输入序列,但数据采集并非易事。因此,为了验证序列比对的方法同时加快分析过程,我们感谢2019-nCoV的研究者们能够与我们分享序列信息。以此为基础,我们将使用MAFFT来构建多序列比对和进化树,对已发表的结果进行验证。

2. 除了对病毒序列进行分析外,我们对于通过B细胞/T细胞测序所得到的2019-nCoV引发的免疫反应数据同样感兴趣。我们乐于接收BCR/TCR序列库数据,并通过我们自己开发的或第三方工具来鉴定潜在的与2019-nCoV相关的BCR/TCR.

若您对以上合作感兴趣的话,请通过以下方式与我们取得联系。

请注意不要在登记表中附上数据本身或其链接。在接到您的请求后,我们会与您联系,讨论关于数据的访问及其他细节问题。

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